Muonion seurakunnan Pappilassa on monenlaista toimintaa. Lasten päiväkerhot ja perhekerhot kokoontuvat Pappilassa, kuten tekevät myös seurakunnan nuoret, Runoryhmä sekä Healing Rooms -rukousklinikka. Pappilassa on myös diakoniatoimisto sekä kirkkoherranvirasto.